Οι φυσικοί θηρευτές των βασιλικών πιγκουίνων περιλαμβάνουν:θαλάσσια λιοντάρια, σφραγίδες λεοπάρδαλης, σφραγίδες γούνας, φάλαινες δολοφόνων και ενδεχομένως καρχαρίες όταν βρίσκονται στο νερό. Όταν βρίσκονται στη γη, ο Skuas αποτελεί επίσης κίνδυνο για τα αυγά και τους νεοσσούς τους, ενώ οι γονείς απομακρύνονται στη θάλασσα.