Ωστόσο, τα τρωκτικά δεν αποτελούν βασικό μέρος της διατροφής τους . Οι Jaguars θα τρώνε συνήθως μόνο τρωκτικά όταν το μεγαλύτερο θήραμα είναι σπάνιο ή μη διαθέσιμο. Μερικά από τα συγκεκριμένα είδη τρωκτικών που μπορεί να καταναλώσει η Jaguar περιλαμβάνει:
* agoutis
* paca
* αρουραίοι
* Squirrels
* Capybaras (αν και αυτά είναι στην πραγματικότητα τα μεγαλύτερα είδη τρωκτικών και θα μπορούσαν να θεωρηθούν μεγαλύτερα λεία)
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι τα συγκεκριμένα είδη τρωκτικών που τρώει η Jaguar θα εξαρτηθεί από τη θέση και τη διαθεσιμότητα του θηραμάτων στο βιότοπό του.