Φυτική ύλη:
* σπόροι: Πρόκειται για μια σημαντική πηγή τροφής, ειδικά χόρτα, άγρια ροή της ερήμου και κάκτες.
* φρούτα: Θα τρώνε ώριμα φρούτα όταν είναι διαθέσιμα.
* φύλλα: Θα χτυπήσουν στα φύλλα, ειδικά σε περιόδους έλλειψης.
* ρίζες και κόνδυλοι: Βγάζουν για αυτές τις υπόγειες πηγές υγρασίας και διατροφής.
ζωική ύλη:
* έντομα: Είναι γνωστό ότι κυνηγούν έντομα, ιδιαίτερα σκαθάρια, ακρίδες και μυρμήγκια.
* Μικρά ασπόνδυλα: Θα καταναλώσουν αράχνες, σκορπιούς και άλλα μικρά ασπόνδυλα.
* αυγά πουλιών: Θα λεηλατούν τα αυγά πουλιών αν προκύψει η ευκαιρία.
* Carrion: Μπορούν να καθαρίσουν τα νεκρά ζώα για τροφή.
Άλλες πηγές τροφίμων:
* μύκητες: Ορισμένα ποντίκια ερήμου θα τρώνε μανιτάρια και άλλους μύκητες.
* Ανθρώπινα απορρίμματα τροφίμων: Μπορούν να μπαίνουν κοντά σε ανθρώπινους οικισμούς για απορριπτόμενα τρόφιμα.
Η συγκεκριμένη διατροφή ενός ποντικιού της ερήμου μπορεί να ποικίλει σε μεγάλο βαθμό ανάλογα με την τοποθεσία του, την εποχή του χρόνου και τη διαθεσιμότητα πηγών τροφίμων.