Υπάρχουν διάφοροι λόγοι για τους οποίους συγκεκριμένες φυλές σκύλων που χρησιμοποιούνται από τους αυτόχθονες λαούς μπορεί να έχουν μειωθεί ή να εξαφανιστεί:
* ασθένεια: Οι εισαγόμενες ασθένειες, όπως το Distemper ή το Rabies, θα μπορούσαν να έχουν αποδεκατίσει τους γηγενείς πληθυσμούς σκύλων.
* Interbreeding: Όταν εισήχθησαν ευρωπαϊκά σκυλιά, η διασταύρωση με τα ιθαγενή σκυλιά θα μπορούσε να έχει αραιωμένα μοναδικά χαρακτηριστικά και να οδηγήσει στην απώλεια συγκεκριμένων φυλών.
* Αλλαγές στον τρόπο ζωής: Η μετάβαση από το νομαδικό κυνήγι στον καθιστικό τρόπο ζωής, λόγω παραγόντων όπως ο αποικισμός και οι κυβερνητικές πολιτικές, μπορεί να έχουν μειώσει την ανάγκη για ορισμένους τύπους σκύλων εργασίας.
* Έλλειψη τεκμηρίωσης: Πολλές φυλές των αυτόχθονων σκύλων δεν ήταν ποτέ επίσημα τεκμηριωμένες ή ταξινομημένες, καθιστώντας δύσκολη την παρακολούθηση της ιστορίας τους και την τελική πτώση.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι οι φυλές των αυτόχθονων σκύλων δεν εξαφανίζονται με αυστηρή βιολογική έννοια. Πολλά από τα χαρακτηριστικά και τα χαρακτηριστικά αυτών των σκύλων επιμένουν στα σκυλιά μικτών που βρίσκονται σε πολλές αυτόχθονες κοινότητες σήμερα.
Είναι απαραίτητο να αποφευχθεί η διαιώνιση των επιβλαβών στερεοτύπων και των γενικεύσεων για τους αυτόχθονες λαούς και την ιστορία τους. Θα πρέπει να επικεντρωθούμε στην κατανόηση της διαφορετικής ιστορίας των αυτόχθονων λαών και των σχέσεών τους με τα σκυλιά με σεβασμό και ακριβή τρόπο.