1. αλατότητα :Οι κοραλλιογενείς ύφαλοι απαιτούν ένα ορισμένο επίπεδο αλατότητας για να ευδοκιμήσουν. Η αλατότητα του νερού στα στόματα των ποταμών είναι συχνά χαμηλότερη από αυτή του ανοιχτού ωκεανού λόγω της εισροής γλυκού νερού από τον ποταμό. Αυτό μπορεί να δυσκολευτεί να επιβιώσουν τα κοράλλια.
2. καθίζηση :Τα ποτάμια φέρουν μεγάλη ποσότητα ιζημάτων, που μπορεί να πνίξει και να βλάψει τους κοραλλιογενείς υφάλους. Το υψηλό επίπεδο καθίζησης στα στόματα των ποταμών μπορεί να δυσκολέψει τις προνύμφες των κοραλλιών να εγκατασταθούν και να αναπτυχθούν.
3. Ρύπανση :Τα ποτάμια συχνά μεταφέρουν ρύπους από γη, όπως λιπάσματα, φυτοφάρμακα και λύματα. Αυτοί οι ρύποι μπορούν να είναι επιβλαβείς για τα κοράλλια και μπορούν να συμβάλουν στη λεύκανση των κοραλλιών και στις ασθένειες.
4. Θερμοκρασία νερού :Το νερό κοντά στα στόματα των ποταμών μπορεί να είναι πιο ζεστό από τον ανοιχτό ωκεανό λόγω της εισροής γλυκού νερού. Αυτό μπορεί να τονίσει τα κοράλλια και να τα καταστήσει πιο ευαίσθητα σε ασθένειες.
5. θολότητα :Το νερό στο στόμα των ποταμών είναι συχνά θολό, που σημαίνει ότι περιέχει πολλά αιωρούμενα σωματίδια. Αυτό μπορεί να μειώσει την ποσότητα φωτός που φτάνει στα κοράλλια, τα οποία μπορούν να εμποδίσουν την ανάπτυξη και τη φωτοσύνθεση.
Ως αποτέλεσμα αυτών των παραγόντων, τα κοράλλια δεν βρίσκονται συνήθως στα στόματα των ποταμών. Προτιμούν να ζουν σε καθαρά, ζεστά και αλμυρά νερά με χαμηλά επίπεδα καθίζησης και ρύπανσης.