1.
- Αγκόλα
- Μπενίν
- Μποτσουάνα
- Μπουρκίνα Φάσο
- Μπουρούντι
- Καμερούν
- Κεντροαφρικανική Δημοκρατία
- Τσαντ
- Λαϊκή Δημοκρατία του Κονγκό
- Δημοκρατία του Κονγκό
- Côte d'Evoire
- Αιθιοπία
- Γκαμπόν
- Γκάμπια
- Γκάνα
- Γουινέα
- Guinea-Bissau
- Κένυα
- Λιβερία
- Μαδαγασκάρη
- Μαλάουι
- Μάλι
- Μαυριτανία
- Μοζαμβίκη
- Ναμίμπια
- Νίγηρας
- Νιγηρία
- Ρουάντα
- Σενεγάλη
- Σιέρα Λεόνε
- Σομαλία
- Νότια Αφρική
- Νότιο Σουδάν
- Σουδάν
- Τανζανία
- Τόγκο
- Ουγκάντα
- Ζάμπια
- Ζιμπάμπουε
2. Βόρεια Αφρική (2 χώρες):
- Αίγυπτος
- Σουδάν (μέρος της Βόρειας Αφρικής)
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι ενώ οι κροκόδειλοι του Νείλου καταλαμβάνουν μια τεράστια περιοχή στην Αφρική, οι διανομές τους σε συγκεκριμένες χώρες μπορεί να διαφέρουν και να μην καλύπτουν απαραίτητα ολόκληρη την περιοχή. Ορισμένες περιοχές μπορούν να έχουν πιο άφθονους πληθυσμούς και κατάλληλους οικοτόπους από άλλους. Επιπλέον, οι τοπικές πληθυσμιακές προσπάθειες και οι προσπάθειες διατήρησης μπορούν να επηρεάσουν την παρουσία και τη διανομή των κροκόδειλων του Νείλου.