1. Απώλεια οικοτόπου: Η σαύρα της Τόνγκα κατοικεί κυρίως σε αυτόχθονα δασικά οικοσυστήματα εντός του 'Eua και του Tongatapu. Δυστυχώς, αυτοί οι δασικοί βιότοποι έχουν εκτεταμένα εκκαθαριστεί για τη γεωργία, την υλοτομία και τους ανθρώπινους οικισμούς. Η απώλεια κατάλληλων οικοτόπων έχει μειώσει σημαντικά την εμβέλεια και το μέγεθος του πληθυσμού της σαύρας.
2. Θηρασία από χωροκατακτητικά είδη: Χωροκατακτητικά είδη, όπως οι άγριες γάτες, οι αρουραίοι και οι μαγκούστες, έχουν εισαχθεί στα νησιά της Τόνγκα και αποτελούν σοβαρή απειλή για τη σαύρα Τόνγκα. Αυτά τα χωροκατακτητικά αρπακτικά έχουν υψηλό αναπαραγωγικό ρυθμό και είναι εξαιρετικά αποτελεσματικά στο κυνήγι και την κατανάλωση της σαύρας, οδηγώντας σε μείωση του πληθυσμού.
3. Κλιματική Αλλαγή: Η Τόνγκα, όπως και άλλα νησιά του Ειρηνικού, είναι ιδιαίτερα ευάλωτη στην κλιματική αλλαγή και στην άνοδο της στάθμης της θάλασσας. Οι αλλαγές στη θερμοκρασία και τα μοτίβα βροχοπτώσεων επηρεάζουν τον βιότοπο και τους πόρους τροφής της σαύρας. Η άνοδος της στάθμης της θάλασσας μπορεί επίσης να πλημμυρίσει παράκτιους οικοτόπους χαμηλού υψομέτρου, μειώνοντας περαιτέρω τη διαθέσιμη εμβέλεια της σαύρας.
4. Περιορισμένο εύρος: Η σαύρα Τόνγκα περιορίζεται γεωγραφικά σε δύο μικρά νησιά στην Τόνγκα, γεγονός που την καθιστά ευάλωτη σε γενετικά ζητήματα όπως η ενδογαμία και η έλλειψη γενετικής ποικιλότητας. Μια περιορισμένη κατανομή αυξάνει επίσης την ευαισθησία σε τοπικές απειλές, όπως η απώλεια οικοτόπων ή ένα μεμονωμένο καταστροφικό γεγονός, που θα μπορούσε να εξαφανίσει μεγάλο μέρος του πληθυσμού.
5. Κυνήγι και εκμετάλλευση: Η σαύρα της Τόνγκα έχει κυνηγηθεί από τους ντόπιους για φαγητό και παραδοσιακή ιατρική, συμβάλλοντας στη μείωση του πληθυσμού. Σε ορισμένες περιπτώσεις, η σαύρα έχει επίσης αιχμαλωτιστεί για το εμπόριο κατοικίδιων ζώων, μειώνοντας περαιτέρω τον αριθμό της.
Ο συνδυασμός της απώλειας οικοτόπων, των χωροκατακτητικών ειδών, της κλιματικής αλλαγής, της περιορισμένης εμβέλειας και του κυνηγιού έχει οδηγήσει σε σοβαρή μείωση του πληθυσμού της σαύρας της Τόνγκα. Οι προσπάθειες διατήρησης, όπως η αποκατάσταση των οικοτόπων, ο έλεγχος των αρπακτικών, η ευαισθητοποίηση του κοινού και τα προγράμματα αναπαραγωγής σε αιχμαλωσία, είναι ζωτικής σημασίας για τη διατήρηση των υπολοίπων πληθυσμών αυτού του κρίσιμα απειλούμενου είδους.