Χέλια του γλυκού νερού: Τα χέλια του γλυκού νερού βρίσκονται σε μια ποικιλία οικοτόπων, όπως ποτάμια, ρυάκια, λίμνες και λίμνες. Μερικά κοινά είδη χελιών γλυκού νερού περιλαμβάνουν το αμερικανικό χέλι (Anguilla rostrata), το οποίο κατοικεί σε συστήματα γλυκού νερού κατά μήκος των ακτών του Ατλαντικού της Βόρειας Αμερικής και το ευρωπαϊκό χέλι (Anguilla anguilla), το οποίο βρίσκεται σε ενδιαιτήματα γλυκού νερού σε όλη την Ευρώπη. Τα χέλια του γλυκού νερού συνήθως ζουν σε ρηχές περιοχές με βλάστηση με λασπώδη ή αμμώδη πυθμένα. Συχνά βρίσκονται κρυμμένοι κάτω από βράχους, κορμούς ή άλλα συντρίμμια.
Θαλάσσια χέλια: Τα θαλάσσια χέλια βρίσκονται σε ένα ευρύ φάσμα ενδιαιτημάτων, συμπεριλαμβανομένων των κοραλλιογενών υφάλων, των βραχωδών ακτών, των αμμωδών παραλιών και των περιβαλλόντων βαθιάς θάλασσας. Μερικά κοινά είδη θαλάσσιων χελιών περιλαμβάνουν το σμέρνα (Muraenidae), το οποίο απαντάται σε κοραλλιογενείς υφάλους και βραχώδη περιβάλλοντα, και το χέλι (Conger conger), το οποίο βρίσκεται σε αμμώδεις και λασπώδεις βυθούς κατά μήκος των ακτών του Ατλαντικού και του Ειρηνικού Ωκεανού. . Τα θαλάσσια χέλια μπορούν να ζουν τόσο σε ρηχά όσο και σε βαθιά νερά και συχνά βρίσκονται κρυμμένα σε σχισμές, σπηλιές ή κάτω από βράχους.
Διάδρομα χέλια: Τα διαδρομικά χέλια περνούν μέρος του κύκλου ζωής τους σε γλυκό νερό και ένα μέρος σε αλμυρό νερό. Αυτά τα είδη γεννούν συνήθως σε γλυκό νερό και τα νεαρά νεογνά μεταναστεύουν στον ωκεανό όπου μεγαλώνουν και ωριμάζουν. Ως ενήλικες, επιστρέφουν στο γλυκό νερό για να αναπαραχθούν. Τα κοινά είδη διάδρομων χελιών περιλαμβάνουν το αμερικανικό και το ευρωπαϊκό χέλι.