Οι καρχαρίες φαλαινών είναι τροφοδότες φίλτρων, που σημαίνει ότι τροφοδοτούν φιλτράροντας μικρούς οργανισμούς από το νερό. Η διατροφή τους αποτελείται κυρίως από πλαγκτόν, μικρά ψάρια, καλαμάρια και καρκινοειδή. Οι καρχαρίες φαλαινών είναι γνωστοί για τα μεγάλα στόματα τους, τα οποία μπορούν να έχουν πλάτος έως και 5 πόδια (1,5 μέτρα), επιτρέποντάς τους να πάρουν μεγάλες ποσότητες νερού και να φιλτράρουν το θήραμά τους. Έχουν πάνω από 3.000 μικροσκοπικά δόντια, αλλά αυτά δεν χρησιμοποιούνται για μάσημα, αλλά για να κρατήσουν το θήραμά τους στο στόμα τους.
νερό
Οι καρχαρίες φαλαινών είναι σε θέση να πίνουν θαλασσινό νερό, αλλά δεν χρειάζεται να πίνουν τόσο νερό όσο άλλα θαλάσσια ζώα επειδή παίρνουν μια σημαντική ποσότητα νερού από τα τρόφιμα που τρώνε. Παίρνουν κυρίως νερό μέσω της διατροφής του πλαγκτόν και άλλων μικρών οργανισμών, οι οποίοι περιέχουν υψηλή ποσότητα νερού.