Τα μαυροπόδαρα κουνάβια κυνηγούν εντοπίζοντας και μπαίνοντας σε λαγούμια σκυλιών λιβαδιών. Χρησιμοποιούν την έντονη αίσθηση της ακοής και της όσφρησής τους για να ανιχνεύσουν την παρουσία σκύλων λιβάδι κάτω από το έδαφος. Μόλις μπει σε ένα λαγούμι, το κουνάβι θα αναζητήσει και θα επιτεθεί στο θήραμά του. Είναι αποτελεσματικά αρπακτικά και μπορούν να σκοτώσουν πολλά σκυλιά λιβαδιού σε μία μόνο συνεδρία κυνηγιού.
Εκτός από τα σκυλιά λιβάδι, τα μαυροπόδαρα κουνάβια μπορεί περιστασιακά να καταναλώνουν άλλα μικρά θηλαστικά όπως σκίουρους, ποντίκια και βολίδες. Είναι επίσης γνωστό ότι τρώνε πουλιά, έντομα και σαύρες, αν και αυτά τα είδη αποτελούν ένα μικρό μέρος της διατροφής τους.
Η εξάρτηση του μαυροπόδαρου κουνάβι στα σκυλιά λιβάδι ως κύρια πηγή τροφής τα καθιστά εξαιρετικά εξειδικευμένα αρπακτικά. Η κατάσταση διατήρησής τους συνδέεται στενά με τη διαθεσιμότητα και την αφθονία των αποικιών σκύλων λιβαδιών. Η μείωση των πληθυσμών των σκύλων λιβάδι λόγω απώλειας οικοτόπων, ασθενειών και προσπαθειών ελέγχου είχε σημαντικό αντίκτυπο στον πληθυσμό των μαυροπόδαρων κουνάβι και συνέβαλε στην κατάστασή τους υπό εξαφάνιση.