Ακολουθεί μια ανάλυση των λόγων:
* Χρωμοσωμικές διαφορές: Τα άλογα έχουν 64 χρωμοσώματα, ενώ τα γαϊδούρια έχουν 62. Αυτή η διαφορά στον αριθμό χρωμοσωμάτων καθιστά πολύ δύσκολο για τους απογόνους τους να αναπτυχθούν σωστά.
* Mules και Hinny: Όταν ένα γαϊδουράκι και ένας σύντροφος αλόγου, οι απόγονοι ονομάζονται Mules (αρσενικό γαϊδουράκι x γυναικείο άλογο) ή hinnies (θηλυκό γαϊδουράκι x αρσενικό άλογο). Αυτά τα υβρίδια είναι συνήθως αποστειρωμένα, που σημαίνει ότι δεν μπορούν να αναπαραχθούν. Αυτή η στειρότητα αποδεικνύει ότι τα γαϊδούρια και τα άλογα είναι γενετικά διακριτά και όχι μόνο παραλλαγές μέσα στο ίδιο είδος.
* Διαφορετικές εξελικτικές διαδρομές: Τα γαϊδουράκια και τα άλογα εξελίσσονται ανεξάρτητα για εκατομμύρια χρόνια, οδηγώντας σε σημαντικές διαφορές στα φυσικά χαρακτηριστικά, τις συμπεριφορές τους και το γενετικό μακιγιάζ.
Ενώ είναι και τα δύο μέλη της οικογένειας Equidae και μοιράζονται πολλές ομοιότητες, η ανικανότητά τους να παράγουν βιώσιμους απογόνους που μπορούν να αναπαραχθούν τους καθιστά ξεχωριστά είδη.