Ωστόσο, σε περιοχές όπου οι πόροι είναι σπάνιοι ή τα εδάφη τους επικαλύπτονται, μπορεί να προκύψουν συγκρούσεις μεταξύ των δύο ειδών. Ο ανταγωνισμός για τα τρόφιμα, τους οικοτόπους και τους κυνηγετικούς χώρους μπορεί να οδηγήσει σε αντιπαραθέσεις και μάχες.
Όταν οι λύκοι συναντούν κογιότ, μπορούν να κυνηγήσουν ενεργά και να τους επιτεθούν για να καθιερώσουν κυριαρχία ή να προστατεύσουν την επικράτειά τους. Οι λύκοι μπορούν μερικές φορές να σκοτώσουν τα κογιότ για να μειώσουν τον ανταγωνισμό. Τέτοιες αλληλεπιδράσεις είναι πιο πιθανές όταν το θήραμα είναι περιορισμένο ή κατά τη διάρκεια της περιόδου αναπαραγωγής όταν και τα δύο είδη υπερασπίζονται τα εδάφη τους.
Από την άλλη πλευρά, τα κογιότ είναι γνωστά για την προσαρμοστικότητα και την επινοητικότητα τους. Σε ορισμένες περιπτώσεις, τα κογιότ μπορούν να αποφύγουν τις άμεσες συγκρούσεις με τους λύκους και να καταφύγουν σε καθαρισμό στα ερείπια του Wolf Prey. Μπορεί επίσης να προσαρμόσουν τις συμπεριφορές τους για το κυνήγι και να αποφύγουν περιοχές όπου η παρουσία του λύκου είναι υψηλή.
Συνολικά, οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ λύκων και κογιότ είναι δυναμικές και μπορούν να κυμαίνονται από τον ανταγωνισμό και τη σύγκρουση έως τη συνύπαρξη και την περιστασιακή συνεργασία σε σπάνιες περιπτώσεις.