* Απώλεια οικοτόπων: Ο οικότοπος της Χιλής φλαμίνγκο απειλείται από ανθρώπινες δραστηριότητες, όπως η εξόρυξη, η γεωργία και η αστική ανάπτυξη.
* Κυνήγι: Τα φλαμίνγκο της Χιλής κυνηγούν για το κρέας, τα φτερά και τα αυγά τους.
* Ρύπανση: Η ρύπανση από την εξόρυξη, τη γεωργία και τα ανθρώπινα απόβλητα αποτελεί επίσης απειλή για το φλαμίνγκο της Χιλής.
* Αλλαγή κλίματος: Η αλλαγή του κλίματος αποτελεί επίσης σημαντική απειλή για το φλαμίνγκο της Χιλής, καθώς προκαλεί την αλλαγή του οικοτόπου τους και γίνεται λιγότερο κατάλληλο για την επιβίωσή τους.
Το Χιλιανό φλαμίνγκο είναι ένα ευάλωτο είδος και ο πληθυσμός του μειώνεται. Εάν δεν αντιμετωπιστούν αυτές οι απειλές, ο Χιλής φλαμίνγκο μπορεί να εξαφανιστεί στο μέλλον.