Ακολουθεί μια κατανομή της ταξινομικής ταξινόμησης τους:
* Κουνέλια:
* Παραγγελία: Λαγομορφά
* Οικογένεια: Leporidae
* Άλογα:
* Παραγγελία: Περισοδάτυλα
* Οικογένεια: Εξισορροπία
Ενώ μπορούν να μοιράζονται κάποιες ομοιότητες, όπως τα φυτοφάγα και να έχουν τέσσερα πόδια, οι διαφορές στην εξελικτική τους ιστορία, η ανατομία και η φυσιολογία είναι αρκετά σημαντικές για να τις τοποθετήσουν σε ξεχωριστές παραγγελίες.
Ακολουθούν μερικές βασικές διαφορές:
* δόντια: Τα κουνέλια έχουν δύο ζευγάρια ανώτερων κοπτήρων, ενώ τα άλογα έχουν μόνο ένα.
* Πεπτικό σύστημα: Τα κουνέλια είναι ζυμωτήρες, ενώ τα άλογα είναι foregut ζυμωτές.
* Δομή της οπλής: Τα κουνέλια έχουν μικρά, πέντε-toed πόδια με νύχια, ενώ τα άλογα έχουν μεγάλες, μονές οπλές.
* Σχήμα σώματος: Τα κουνέλια είναι συνήθως μικρότερα και έχουν πιο συμπαγή κατασκευή, ενώ τα άλογα είναι μεγαλύτερα και έχουν ένα πιο επιμήκη σώμα.
Συμπερασματικά, ενώ τα κουνέλια και τα άλογα μπορεί να μοιράζονται κάποια κοινά χαρακτηριστικά, δεν είναι στενά συνδεδεμένα και ανήκουν σε διαφορετικές ταξινομικές ομάδες.