- Απώλεια οικοτόπου :Ο πρωταρχικός βιότοπος του πυγμαίου κουνελιού είναι η στέπα και η δασική άρκευθος, τα οποία μετατρέπονται γρήγορα σε γεωργική και οικιστική ανάπτυξη. Αυτή η απώλεια ενδιαιτημάτων έχει κατακερματίσει τον πληθυσμό του πυγμαίου κουνελιού, καθιστώντας το πιο ευάλωτο σε θηρευτές και ασθένειες.
- Θηρασία :Τα πυγμαία κουνέλια θηρεύονται από μια ποικιλία αρπακτικών, συμπεριλαμβανομένων των κογιότ, των αλεπούδων, των ασβών και των αρπακτικών πτηνών. Καθώς ο βιότοπος του πυγμαίου κουνελιού είναι κατακερματισμένος, γίνεται ευκολότερο για τα αρπακτικά να έχουν πρόσβαση και να τα σκοτώσουν.
- Διαγωνισμός :Τα πυγμαία κουνέλια ανταγωνίζονται άλλα μικρά θηλαστικά, όπως οι πίκες και οι βολίδες, για τροφή και καταφύγιο. Αυτός ο ανταγωνισμός μπορεί να περιορίσει την ικανότητα του πυγμαίου κουνελιού να επιβιώσει και να αναπαραχθεί.
- Ασθένεια :Τα πυγμαία κουνέλια είναι ευαίσθητα σε διάφορες ασθένειες, συμπεριλαμβανομένης της τουλαραιμίας, της πανώλης και της κοκκιδίωσης. Αυτές οι ασθένειες μπορούν να εξαπλωθούν γρήγορα στον πληθυσμό, προκαλώντας ευρεία θνησιμότητα.
- Κλιματική Αλλαγή :Η κλιματική αλλαγή είναι επίσης μια απειλή για το πυγμαίο κουνέλι. Η στέπα και το δάσος της αρκεύθου αναμένεται να παρουσιάσουν αυξημένες θερμοκρασίες και μειωμένες βροχοπτώσεις, γεγονός που θα δυσκολέψει την επιβίωση του πυγμαίου κουνελιού.
Λόγω αυτών των απειλών, το πυγμαίο κουνέλι θεωρείται ένα από τα πιο απειλούμενα θηλαστικά στη Βόρεια Αμερική. Γίνονται προσπάθειες διατήρησης για την προστασία του πυγμαίου κουνελιού και του οικοτόπου του, συμπεριλαμβανομένης της αποκατάστασης των οικοτόπων, του ελέγχου των θηρευτών και της διαχείρισης ασθενειών.