Κυνήγι και λαθροθηρία: Ο αίγαγρος των Απεννίνων έχει κυνηγηθεί για το κρέας, τη γούνα και τα κέρατα του εδώ και αιώνες. Παρά τις νομικές προστασίες, το παράνομο κυνήγι και η λαθροθηρία εξακολουθούν να συμβαίνουν και αποτελούν σημαντική απειλή για τον πληθυσμό του αίγαγρου.
Διαγωνισμός με κατοικίδια ζώα: Τα εγχώρια ζώα, όπως τα πρόβατα και οι κατσίκες, ανταγωνίζονται τους αιγάγρους για τροφή και πόρους. Αυτός ο ανταγωνισμός μπορεί να μειώσει την ικανότητα του αίγαγρου να επιβιώσει και να αναπαραχθεί, ειδικά κατά τους σκληρούς χειμώνες που η τροφή είναι σπάνια.
Ασθένεια: Ο αίγαγρος των Απεννίνων είναι ευαίσθητος σε διάφορες ασθένειες, συμπεριλαμβανομένου του πνεύμονα, του αφθώδους πυρετού και της βρουκέλλωσης. Αυτές οι ασθένειες μπορούν να εξαπλωθούν γρήγορα στον πληθυσμό του αίγαγρου και να προκαλέσουν σημαντική θνησιμότητα.
Κλιματική αλλαγή: Η κλιματική αλλαγή προκαλεί ραγδαία αλλαγή του οικοτόπου του αίγαγρου των Απεννίνων. Η άνοδος της θερμοκρασίας και οι αλλαγές στα μοτίβα βροχοπτώσεων επηρεάζουν τη βλάστηση και την χιονοκάλυψη, δυσκολεύοντας τους αιγάγρους να βρουν τροφή και καταφύγιο.