Στην κατηγορία των ψαριών, ο φαλαινοκαρχαρίας ταξινομείται περαιτέρω ως εξής:
- Κατηγορία:Χονδριχθύες (χονδροειδή ψάρια)
- Υποκατηγορία:Elasmobranchii (καρχαρίες και ακτίνες)
- Σειρά:Orectolobiformes (καρχαρίες χαλιών, φαλαινοκαρχαρίες και wobbegongs)
- Οικογένεια:Rhincodontidae (οικογένεια φαλαινοκαρχαριών)
- Γένος:Rhincodon
- Είδος:Rhincodon typus
Ο φαλαινοκαρχαρίας είναι το μόνο είδος της οικογένειας Rhincodontidae και το μεγαλύτερο γνωστό ζωντανό είδος ψαριού, που φτάνει τα 18 μέτρα (59 πόδια) και ζυγίζει περίπου 12 τόνους. Χαρακτηρίζεται από την ήπια συμπεριφορά φίλτρου, τρέφεται κυρίως με πλαγκτόν, μικρά ψάρια και καρκινοειδή.