Δεν συνιστάται η χρήση καθαριστικού φυκιών καθόλου. Εάν η δεξαμενή καθαρίζεται τακτικά και έχει ελάχιστα σημεία από φύκια, ο χειροκίνητος καθαρισμός με μια οδοντόβουρτσα ή μια ξύστρα φυκιών είναι ένας αποτελεσματικός τρόπος για να αφαιρέσετε τα σημεία. Εάν η δεξαμενή έχει πολλά σημεία από φύκια λόγω της σπανιότητας μεταξύ των καθαρισμών, εξετάστε το ενδεχόμενο να αυξήσετε τον τακτικό καθαρισμό της δεξαμενής.
Τα καθαριστικά φυκιών μπορεί να είναι επιβλαβή για τα ψάρια και τους άλλους κατοίκους του ενυδρείου, καθώς και για τα ευεργετικά βακτήρια που ζουν στο φίλτρο. Εάν τα φύκια γίνουν πρόβλημα, είναι καλύτερο να προσπαθήσετε να τα αφαιρέσετε μειώνοντας την ποσότητα φωτός που δέχεται η δεξαμενή, αυξάνοντας την κυκλοφορία του νερού ή/και προσθέτοντας μερικά ψάρια ή ασπόνδυλα που τρώνε φύκια.