1. Οι φάλαινες συχνά αλιεύονται ακούσια στα δίχτυα αλιείας που προορίζονται για άλλα είδη. Αυτό το "benscatch" αποτελεί σημαντική απειλή, ειδικά για τις μικρότερες φάλαινες και τα δελφίνια. Η εξάντληση των αποθεμάτων ιχθύων επηρεάζει επίσης την προσφορά τροφίμων των φαλαινών, που τους θέτει σε κίνδυνο.
2. Απώλεια και αποικοδόμηση οικοτόπων: Οι φάλαινες βασίζονται σε συγκεκριμένα ενδιαιτήματα για αναπαραγωγή, σίτιση και μετανάστευση. Η ρύπανση, οι πετρελαιοκηλίδες και η παράκτια ανάπτυξη καταστρέφουν και υποβαθμίζουν αυτά τα ενδιαιτήματα, επηρεάζοντας την ικανότητά τους να επιβιώσουν.
3. Αλλαγή κλίματος: Η θέρμανση των ωκεανών και η οξίνιση λόγω της αλλαγής του κλίματος διαταράσσουν τα οικοσυστήματα φαλαινών. Αυτό επηρεάζει τις πηγές τροφίμων, τα πρότυπα μετανάστευσης και τη γενική υγεία, καθιστώντας τα πιο ευάλωτα σε ασθένειες και απειλές.
Αυτοί είναι μόνο μερικοί λόγοι για τους οποίους οι φάλαινες απειλούνται. Άλλοι παράγοντες περιλαμβάνουν απεργίες πλοίων, ηχορύπανση και εμπλοκή σε θαλάσσια συντρίμμια.