#### 1. Επιστημονικό Πρόγραμμα Φαλαινοθηρίας στον Βόρειο Ειρηνικό και στον Ανταρκτικό Ωκεανό (JARPA)
Το Επιστημονικό Ερευνητικό Πρόγραμμα Φαλαινοθηρίας, γνωστό και ως JARPA, διεξάγεται βάσει ειδικών αδειών που εκδίδονται από την ιαπωνική κυβέρνηση. Το JARPA σχεδιάστηκε για τη συλλογή επιστημονικών δεδομένων για πολλά είδη φαλαινών, συμπεριλαμβανομένων των φαλαινών minke, των φαλαινών sei και των φαλαινών με πτερύγια. Ωστόσο, σύμφωνα με το διεθνές δίκαιο των θαλασσών, η θανατηφόρα επιστημονική έρευνα σε ζώα επιτρέπεται μόνο εάν άλλα μη θανατηφόρα μέσα δεν επαρκούν για τη λήψη των απαραίτητων πληροφοριών.
Αφού το Διεθνές Δικαστήριο της Δικαιοσύνης (ICJ) έκρινε τον Μάρτιο του 2014 ότι το πρόγραμμα JARPA II της Ιαπωνίας στην Ανταρκτική δεν ήταν για σκοπούς επιστημονικής έρευνας, η Ιαπωνία διέκοψε αυτό το πρόγραμμα. Ωστόσο, η Ιαπωνία ξεκίνησε ένα νέο πρόγραμμα, το JARPA II Special Permit, τον Δεκέμβριο του 2015. Η ιαπωνική κυβέρνηση παρουσίασε μια λίστα με 12 επιστημονικές ερωτήσεις ως επιστημονική βάση για το πρόγραμμα. Ωστόσο, το ICJ αποφάσισε ότι το πρόγραμμα δεν είχε τροποποιηθεί ουσιαστικά από το πρόγραμμα JARPA II και αποφάσισε τον Δεκέμβριο του 2021 ότι το συνεχιζόμενο πρόγραμμα «επιστημονικής φαλαινοθηρίας» παραβίαζε επίσης το διεθνές δίκαιο.
#### 2. Παράκτια φαλαινοθηρία για τοπική κατανάλωση
Η Ιαπωνία έχει επίσης ένα πρόγραμμα παράκτιας φαλαινοθηρίας που στοχεύει τις φάλαινες μινκ κατά μήκος της ακτής της. Η κυβέρνηση ορίζει μια ποσόστωση για τον αριθμό των φαλαινών που μπορούν να αλιευθούν από κάθε ομάδα ή λοβό φαλαινών. Το κρέας των φαλαινών που αλιεύονται στη συνέχεια πωλείται τοπικά.
Ωστόσο, ομάδες προστασίας έχουν εκφράσει ανησυχίες για τη βιωσιμότητα της παράκτιας φαλαινοθηρίας. Υποστηρίζουν ότι οι ποσοστώσεις είναι πολύ υψηλές και ότι είναι δύσκολο να παρακολουθηθούν με ακρίβεια οι πληθυσμοί των φαλαινών στα παράκτια ύδατα.