Η σύγκρουση της νύχτας John επικεντρώνεται γύρω από την καταπιεστική κοινωνική και φυλετική δυναμική στην εποχή του Jim Crow South, όπου οι Αφροαμερικανοί αντιμετώπισαν σοβαρές διακρίσεις, διαχωρισμό και περιορισμένη πρόσβαση στην εκπαίδευση και τις ευκαιρίες. Το μυθιστόρημα υπογραμμίζει τους αγώνες των υποδουλωμένων ανθρώπων και τα μήκη που πήγαν να αποκτήσουν γνώση και γραμματισμό σε έναν κόσμο που επιδίωξε να τους κρατήσει άγνοια.
Η πρωταρχική σύγκρουση περιστρέφεται γύρω από τον κύριο χαρακτήρα, ο John, ο οποίος διδάσκει κρυφά άλλους υποδουλωμένους ανθρώπους να διαβάζουν και να γράφουν τη νύχτα, αψηφώντας τους νόμους που απαγόρευαν την εκπαίδευση για τους Αφροαμερικανούς. Αυτή η πράξη αντίστασης ενάντια στο καταπιεστικό σύστημα θέτει τον John και τους μαθητές του σε κίνδυνο, καθώς οποιαδήποτε ανακάλυψη θα μπορούσε να οδηγήσει σε σοβαρή τιμωρία, συμπεριλαμβανομένων των ξυλοδαρμών ή ακόμα και του θανάτου.
Το μυθιστόρημα διερευνά επίσης τις εσωτερικές συγκρούσεις των χαρακτήρων καθώς περιηγούνται στην επιθυμία τους για ελευθερία, ισότητα και αυτο-έκφραση μέσα στη συστηματική καταπίεση. Το ταξίδι του Ιωάννη χαρακτηρίζεται από έναν μετασχηματισμό από το φόβο και την αυτοπεποίθηση στο θάρρος και την αποφασιστικότητα, καθώς γίνεται φάρος ελπίδας για τους συναδέλφους του υποδουλωμένους ανθρώπους.
Επιπλέον, η σύγκρουση εκτείνεται στη λευκή κοινότητα, που εκπροσωπείται από χαρακτήρες όπως ο ιδιοκτήτης φυτειών κ. Waller, οι οποίοι είναι αποφασισμένοι να διατηρήσουν το status quo και να επιβάλουν την εξουσία τους πάνω στον υποδουλωμένο πληθυσμό. Η αντίσταση στην εκπαίδευση για τους Αφροαμερικανούς θεωρείται ως μέσο για τη διατήρηση του ελέγχου και την αποτροπή οποιασδήποτε διαταραχής της υπάρχουσας κοινωνικής τάξης.
Τελικά, η νύχτα ο John παρουσιάζει μια ισχυρή απεικόνιση του αγώνα για τα πολιτικά δικαιώματα, υπογραμμίζοντας την ανθρώπινη επιθυμία για γνώση και την ανθεκτικότητα του ανθρώπινου πνεύματος ενάντια στην καταπίεση.