Στο γυναικείο αναπαραγωγικό σύστημα, οι ωοθήκες είναι υπεύθυνες για την παραγωγή και την απελευθέρωση αυγών. Αυτή η διαδικασία ρυθμίζεται από διάφορες ορμόνες, κυρίως οιστρογόνο και προγεστερόνη. Αυτές οι ορμόνες παράγονται από τις ίδιες τις ωοθήκες και τον αδένα της υπόφυσης στον εγκέφαλο και εργάζονται μαζί για να ελέγξουν τον κύκλο της εμμηνορροϊκής.
Το οιστρογόνο διαδραματίζει κρίσιμο ρόλο στα αρχικά στάδια του εμμηνορροϊκού κύκλου. Καθώς τα επίπεδα οιστρογόνων αυξάνονται, διεγείρουν την ανάπτυξη και την ανάπτυξη ωοθυλακίων μέσα στις ωοθήκες. Κάθε θυλάκιο περιέχει ένα ανώριμο αυγό. Όταν τα επίπεδα οιστρογόνων φθάνουν στην κορυφή, ενεργοποιεί την απελευθέρωση της ωοειδούς ορμόνης (LH) από την υπόφυση. Το LH προκαλεί την εμφάνιση της ωορρηξίας, απελευθερώνοντας ένα ώριμο αυγό από την ωοθήκη.
Η προγεστερόνη, από την άλλη πλευρά, γίνεται κυρίαρχη στο δεύτερο μισό του εμμηνορροϊκού κύκλου. Βοηθά στην προετοιμασία της μήτρας για την πιθανή εμφύτευση ενός γονιμοποιημένου αυγού. Εάν δεν συμβεί γονιμοποίηση, τα επίπεδα προγεστερόνης μειώνονται, οδηγώντας στην αποβολή της επένδυσης της μήτρας κατά τη διάρκεια της εμμηνόρροιας.
Η αλληλεπίδραση του οιστρογόνου και της προγεστερόνης εξασφαλίζει τον ακριβή χρονισμό και συντονισμό της ωορρηξίας και άλλων γεγονότων στον εμμηνορροϊκό κύκλο. Οι ορμονικές ανισορροπίες ή οι διαταραχές μπορούν να επηρεάσουν την ωορρηξία και να συμβάλλουν σε ακανόνιστους κύκλους εμμηνορροϊκής ή ζητήματα γονιμότητας.