Οι Jaguars προτιμούν πυκνή βλάστηση με πρόσβαση σε πηγές νερού, καθώς είναι εξειδικευμένοι κολυμβητές και συχνά κυνηγούν και πίνουν κοντά στα υδάτινα σώματα. Καθιερώνουν σπιτικές περιοχές που ποικίλλουν σε μέγεθος ανάλογα με τη διαθεσιμότητα θηραμάτων, αλλά οι σειρές των ανδρών μπορούν να καλύψουν αρκετές εκατοντάδες τετραγωνικά χιλιόμετρα.
Μέσα στα ενδιαιτήματά τους, οι Jaguars διαδραματίζουν κρίσιμους οικολογικούς ρόλους ως κορυφαίους θηρευτές, βοηθώντας στη διατήρηση της ισορροπίας του οικοσυστήματος ρυθμίζοντας τους πληθυσμούς των θηραμάτων. Είναι μοναχικά ζώα και συχνά καταλαμβάνουν οικοτόπους με ποικίλα είδη θηραμάτων, όπως ελάφια, peccary, capybaras, tapirs και πολλά άλλα.
Οι προσπάθειες διατήρησης για τους Jaguars περιλαμβάνουν τη διατήρηση και την προστασία των οικοτόπων τους για να εξασφαλίσουν τη μακροπρόθεσμη επιβίωση αυτών των θαυμάσιων και οικολογικά σημαντικών θηρευτών αιλουροειδών.