Απώλεια και κατακερματισμός οικοτόπων :Οι τζάγκουαρ απαιτούν εκτεταμένες περιοχές και ποικίλους βιότοπους για επιβίωση. Δυστυχώς, οι φυσικοί τους βιότοποι χάνονται και κατακερματίζονται γρήγορα λόγω της αποψίλωσης των δασών, της επέκτασης της γεωργίας, της ανάπτυξης υποδομών και της αστικής ανάπτυξης. Αυτό όχι μόνο μειώνει τον διαθέσιμο χώρο για την περιπλάνηση των τζάγκουαρ, αλλά επίσης διαταράσσει τα πρότυπα αναπαραγωγής, διατροφής και μετανάστευσης.
Σύγκρουση ανθρώπου-άγριας ζωής :Καθώς οι ανθρώπινοι οικισμοί επεκτείνονται σε ενδιαιτήματα για τζάγκουαρ, προκύπτουν συγκρούσεις όταν οι τζάγκουαρ κυνηγούν τα ζώα. Αυτό μπορεί να οδηγήσει σε αντίποινα από αγρότες και κτηνοτρόφους, με αποτέλεσμα τη θανάτωση τζάγκουαρ. Επιπλέον, οι τζάγκουαρ μπορεί να σκοτωθούν εάν αποτελούν αντιληπτή απειλή για την ανθρώπινη ασφάλεια ή θεωρούνται ενόχληση.
Κλιματική αλλαγή :Οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής, όπως τα αλλοιωμένα πρότυπα βροχοπτώσεων, η αύξηση της θερμοκρασίας και η αυξημένη συχνότητα ακραίων καιρικών φαινομένων, επηρεάζουν τα ενδιαιτήματα του τζάγκουαρ και τους πληθυσμούς θηραμάτων. Αυτές οι αλλαγές διαταράσσουν το οικοσύστημα και καθιστούν πιο δύσκολο για τους τζάγκουαρ να επιβιώσουν και να αναπαραχθούν με επιτυχία.
Περιορισμένη γενετική ποικιλότητα :Οι τζάγκουαρ έχουν σχετικά χαμηλή γενετική ποικιλότητα σε σύγκριση με άλλα είδη μεγάλων γατών. Αυτό τα καθιστά πιο ευάλωτα στις επιπτώσεις της απώλειας οικοτόπων, του κυνηγιού και άλλων παραγόντων που μπορούν να διαταράξουν τους πληθυσμούς τους. Η χαμηλή γενετική ποικιλότητα μπορεί να μειώσει την ικανότητα του είδους να προσαρμοστεί στις περιβαλλοντικές αλλαγές και να αυξήσει τον κίνδυνο ενδογαμίας.