Η εποχή του Πλειστοκένιου ήταν επίσης μια εποχή megafauna, ή γιγαντιαία ζώα. Το μεγαλύτερο από αυτά τα ζώα ήταν το Mastodon, ένας τεράστιος συγγενής του σύγχρονου ελέφαντα που θα μπορούσε να φτάσει σε ύψη μέχρι 13 πόδια και ζυγίζει μέχρι 8 τόνους. Άλλες Megafauna που έζησαν στο Κεντάκι εκείνη τη στιγμή περιλάμβαναν το Mammoth, το Giant Bison, το Bear Bear και το Dire Wolf.
Με το κλίμα θέρμανσης στο τέλος της εποχής του Πλειστοκένιου, αυτά τα ζώα σταδιακά εξαφανίστηκαν. Οι τελευταίοι μαστόδοι εξαφανίστηκαν από τη Βόρεια Αμερική πριν από περίπου 11.000 χρόνια, ενώ οι τελευταίοι μαμούθ πέθαναν πριν από περίπου 10.000 χρόνια.
Σήμερα, το Κεντάκι φιλοξενεί μια μεγάλη ποικιλία φυτών και ζώων που είναι πιο προσαρμοσμένα στο σημερινό κλίμα του κράτους. Τα δάση κυριαρχούνται από δρυς, σφενδάμι και δέντρα, ενώ τα λιβάδια φιλοξενούν μια ποικιλία από χόρτα, αγριολούλουδα και θάμνους. Η τουνό έχει εξαφανιστεί από το Κεντάκι, αλλά το κράτος εξακολουθεί να φιλοξενεί μια ποικιλία ζώων που βρίσκονται σε ψυχρότερα κλίματα, όπως το Snowshoe Hare, το Red Fox και το White-Tailed Deer.