Ο χρωματισμός της γούνας του Beagle καθορίζεται σε μεγάλο βαθμό από τη γενετική. Συγκεκριμένα, θεωρείται ότι είναι το αποτέλεσμα πολλών διαφορετικών γονιδίων που αλληλεπιδρούν για να παράγουν το μοτίβο τρίχρωμου. Αυτά τα γονίδια επηρεάζουν την παραγωγή και την κατανομή της μελανίνης, η οποία είναι η χρωστική ουσία που δίνει χρώμα στο δέρμα, τα μαλλιά και τα μάτια.
Ακολουθεί μια απλοποιημένη εξήγηση της γενετικής πίσω από το παλτό Tricolor του Beagle:
- μαύρο (e locus) :Το μαύρο χρώμα στα beagles ελέγχεται κυρίως από τον τόπο επέκτασης (e locus). Το κυρίαρχο αλληλόμορφο Ε είναι υπεύθυνο για την έκφραση της μαύρης χρωστικής, ενώ το υπολειπόμενο αλληλόμορφο Ε έχει ως αποτέλεσμα την έλλειψη μαύρης χρωστικής ουσίας.
- Brown (b locus) :Ο καφέ χρωματισμός είναι αποτέλεσμα του καφέ τόπου (B locus). Το κυρίαρχο αλληλόμορφο Β παράγει καφέ χρωστική, ενώ το υπολειπόμενο αλληλόμορφο Β οδηγεί σε μαύρη χρωστική ουσία.
- λευκό (w locus) :Τα λευκά μπαλώματα στο παλτό του Beagle προκαλούνται από τον λευκό τόπο κηλίδων (Wocus W). Το κυρίαρχο αλληλόμορφο W είναι υπεύθυνο για τα λευκά σημάδια, ενώ το υπολειπόμενο αλληλόμορφο W έχει ως αποτέλεσμα ένα στερεό χρώμα.
Οι αλληλεπιδράσεις αυτών των γονιδίων, μαζί με άλλα γονίδια τροποποιητή, καθορίζουν τα συγκεκριμένα σχέδια χρώματος που παρατηρούνται σε beagles. Για παράδειγμα, ο συνδυασμός του κυρίαρχου αλληλόμορφου Ε, του υπολειπόμενου αλληλόμορφου Β και του κυρίαρχου αλληλόμορφου W θα παράγει ένα ασπρόμαυρο Beagle, ενώ το κυρίαρχο αλληλόμορφο Ε, το κυρίαρχο αλληλόμορφο Β και το κυρίαρχο αλληλόμορφο W θα οδηγούσε σε ένα τρισδιάστατο beagle με μαύρο, καφέ και λευκές σημάνσεις.
Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι η γενετική βάση του χρωματισμού των παλτών σε σκύλους είναι πολύπλοκη και μπορεί να υπάρχουν πρόσθετα γονίδια και αλληλεπιδράσεις που εμπλέκονται στον προσδιορισμό των ακριβών χρωμάτων που παρατηρούνται σε beagles.