1. Δομή κυττάρων: Οι πρωτόζωοι είναι μονοκύτταροι οργανισμοί, ενώ τα ζώα είναι πολυκύτταρα. Τα πρωτόζωα είναι πλήρη, ανεξάρτητα κύτταρα ικανά να πραγματοποιούν όλες τις βασικές διαδικασίες ζωής μέσα στη δομή τους με ένα κύτταρο. Αντίθετα, τα ζώα αποτελούνται από πολλά κύτταρα που συνεργάζονται για να σχηματίσουν ιστούς, όργανα και συστήματα οργάνων, με αποτέλεσμα υψηλότερο επίπεδο δομικής οργάνωσης και εξειδίκευσης.
2. Μετακίνηση: Οι περισσότεροι πρωτόζωοι έχουν εξειδικευμένες δομές για κίνηση, όπως flagella, cilia ή pseudopodia. Αυτές οι δομές τους επιτρέπουν να κολυμπούν, να γλιστρούν ή να σέρνουν στο περιβάλλον τους. Τα ζώα, από την άλλη πλευρά, εμφανίζουν μια μεγάλη ποικιλία μεθόδων μετακίνησης. Μπορούν να περπατούν, να τρέχουν, να πηδούν, να κολυμπήσουν, να πετάξουν ή να ανιχνεύσουν, χρησιμοποιώντας εξειδικευμένες δομές όπως τα πόδια, τα φτερά, τα πτερύγια ή άλλες προσαρμογές.
3. Διατροφική λειτουργία: Τα πρωτόζωα παρουσιάζουν διαφορετικούς τρόπους διατροφής. Μερικοί είναι φωτοαυτοτροφικοί, που σημαίνει ότι μπορούν να συνθέσουν το δικό τους φαγητό μέσω της φωτοσύνθεσης, παρόμοια με τα φυτά. Άλλοι είναι ετεροτροφικοί, πράγμα που σημαίνει ότι αποκτούν τα τρόφιμά τους με την κατάποση άλλων οργανισμών, συμπεριλαμβανομένων των βακτηριδίων, των άλγη και άλλων πρωτόζωων. Τα ζώα, αντίθετα, είναι κυρίως ετεροτροφικά και καταναλώνουν μια ποικιλία οργανικών ουσιών όπως φυτά, άλλα ζώα ή οργανικά συντρίμμια.
4. Habitat and Distribution: Τα πρωτόζωα είναι απίστευτα ευπροσάρμοστα και μπορούν να βρεθούν σε ένα ευρύ φάσμα οικοτόπων, από περιβάλλοντα γλυκού νερού όπως λίμνες και λίμνες έως θαλάσσια περιβάλλοντα, έδαφος και ακόμη και μέσα σε άλλους οργανισμούς ως συμβιτίνες ή παράσιτα. Τα ζώα, από την άλλη πλευρά, έχουν προσαρμοστεί σε διάφορες οικολογικές θέσεις, καταλαμβάνουν οικοτόπους όπως χερσαία, υδρόβια και εναέρια περιβάλλοντα.
5. Εξελικτική ιστορία: Τα πρωτόζωα θεωρούνται ότι είναι από τις πρώτες μορφές ευκαρυωτικών οργανισμών και αντιπροσωπεύουν μια αρχαία γενεαλογία. Έχουν υπάρξει στη Γη για εκατοντάδες εκατομμύρια χρόνια, που προηγήθηκε της εμφάνισης των ζώων. Τα ζώα εξελίχθηκαν αργότερα στην εξελικτική ιστορία, που προέρχονται από έναν κοινό πρόγονο με πρωτόζωους.
Συνοπτικά, η πρωταρχική διαφορά μεταξύ των πρωτόζωων και των ζώων έγκειται στην κυτταρική τους οργάνωση. Τα πρωτόζωα είναι μονοκύτταροι οργανισμοί, ενώ τα ζώα είναι πολυκύτταροι οργανισμοί που εμφανίζουν σύνθετα συστήματα ιστού και οργάνων. Η μετακίνηση, οι τρόποι διατροφής, τα ενδιαιτήματα και οι εξελικτικές ιστορίες διαφέρουν επίσης σημαντικά. Η κατανόηση αυτών των διακρίσεων παρέχει πληροφορίες για την ποικιλομορφία και την πολυπλοκότητα των μορφών ζωής στη Γη.