Τα απειλούμενα είδη που βρίσκονται τώρα μόνο σε ζωολογικούς κήπους συχνά προέρχονται από μικρούς, απομονωμένους πληθυσμούς που έχουν μειωθεί σε εξαιρετικά χαμηλούς αριθμούς λόγω διαφόρων παραγόντων όπως η απώλεια οικοτόπων, το κυνήγι και η υπερεκμετάλλευση. Όταν αυτά τα είδη εισάγονται σε ζωολογικούς κήπους για λόγους διατήρησης και αναπαραγωγής, μπορεί να φέρουν μόνο ένα κλάσμα της γενετικής ποικιλότητας που υπήρχε στον άγριο πληθυσμό.
Καθώς αυτά τα είδη αναπαράγονται στην αιχμαλωσία, η περιορισμένη γενετική παραλλαγή συγκεντρώνεται περαιτέρω, με αποτέλεσμα την απώλεια αλληλόμορφων και τη μείωση της γενετικής ποικιλότητας. Με την πάροδο του χρόνου, αυτό μπορεί να έχει αρνητικές επιπτώσεις στην ικανότητα του είδους να προσαρμοστεί στις μεταβαλλόμενες περιβαλλοντικές συνθήκες και στην αυξημένη ευαισθησία σε ασθένειες, καθιστώντας τα πιο ευάλωτα στην εξαφάνιση.
Για τον μετριασμό των επιπτώσεων του ιδρυτικού αποτελέσματος και τη διατήρηση της γενετικής ποικιλότητας, τα προγράμματα διατήρησης στους ζωολογικούς κήπους συχνά εφαρμόζουν στρατηγικές όπως η επιλεκτική αναπαραγωγή, η διαχείριση του πληθυσμού και η γενετική διάσωση. Αυτά τα μέτρα στοχεύουν στην εισαγωγή νέου γενετικού υλικού σε αιχμάλωτους πληθυσμούς, στη διατήρηση της γενετικής ποικιλότητας και στη μείωση του κινδύνου κατάθλιψης ενδογαμίας και άλλων γενετικών προβλημάτων που μπορεί να προκύψουν από χαμηλή γενετική διαφοροποίηση.