θηλαστικά:
* Η σαύρα τοίχου της Μάλτας: Αυτό είναι το πιο συχνά εντατικό ερπετό στη Μάλτα και είναι ενδημική στο νησί.
* Ο Μαλτέος σκαντζόχοιρος: Παρόλο που εισήχθη στη δεκαετία του 1970, έχει γίνει από τότε καθιερωμένο στα νησιά.
* νυχτερίδες: Η Μάλτα φιλοξενεί μερικά είδη νυχτερίδων, συμπεριλαμβανομένου του πεταλούδα και του μεσογειακού Pipistrelle.
Πουλιά:
* Η Μαλτέζικη Shearwater: Πρόκειται για ένα θαλάσσιο πτηνό που αναπαράγεται στα νησιά της Μάλτας και είναι ένα προστατευμένο είδος.
* Το rock sparrow: Ένα κοινό πουλί που βρέθηκε στα νησιά της Μάλτας.
* Το yelkouan shearwater: Αυτή η απειλούμενη φυλές πουλιών στα νησιά της Μάλτας και αποτελεί βασική εστίαση για τις προσπάθειες διατήρησης.
* Το falcon peregrine: Αυτό το Bird of Prey βρίσκεται στη Μάλτα, αν και οι αριθμοί του είναι περιορισμένοι.
Άλλα ζώα:
* Διάφορα είδη ψαριών: Η γύρω Μεσογειακή Θάλασσα φιλοξενεί ένα ευρύ φάσμα ειδών ψαριών.
* έντομα: Τα νησιά της Μάλτας φιλοξενούν μια μεγάλη ποικιλία ειδών εντόμων, συμπεριλαμβανομένων πεταλούδων, σκώρων και σκαφών.
Εισαγόμενα είδη:
* γάτες: Οι εγχώριες γάτες εισήχθησαν στη Μάλτα και είναι τώρα ένα κοινό θέαμα.
* Σκύλοι: Παρόμοια με τις γάτες, τα σκυλιά μεταφέρθηκαν στη Μάλτα από ανθρώπους και τώρα βρίσκονται σε όλα τα νησιά.
Αξίζει να σημειωθεί ότι η Μάλτα είναι ένα νησιωτικό έθνος, οπότε η εγγενής πανίδα της είναι περιορισμένη σε σύγκριση με τις χώρες της ηπειρωτικής χώρας. Τα νησιά έχουν επηρεαστεί σε μεγάλο βαθμό από τους ανθρώπους, οδηγώντας στην εισαγωγή διαφόρων ζωικών ειδών με την πάροδο του χρόνου.