Ασεξουαλική αναπαραγωγή:Πολλοί μονοκύτταροι οργανισμοί αναπαράγουν ασεξικά, πράγμα που σημαίνει ότι παράγουν απογόνους γενετικά ταυτόσημους με τον εαυτό τους. Σε τέτοιες περιπτώσεις, η έννοια της διασταύρωσης και η ανταλλαγή γενετικού υλικού μεταξύ διαφορετικών ατόμων γίνεται άσχετη.
Έλλειψη σαφών ορίων:Οι μονοκύτταροι οργανισμοί συχνά υπάρχουν ως πληθυσμοί, όπου τα άτομα μπορούν να ανταλλάξουν γενετικό υλικό μέσω διαφόρων μηχανισμών όπως η σύζευξη, ο μετασχηματισμός ή η μεταγωγή. Αυτές οι διαδικασίες μπορούν να εμφανιστούν μεταξύ γενετικά διαφορετικών ατόμων, καθιστώντας δύσκολη την περιγραφή των διαφορετικών ορίων των ειδών που βασίζονται αποκλειστικά στη διασταύρωση.
Η οριζόντια μεταφορά γονιδίων:η οριζόντια μεταφορά γονιδίων είναι ένα κοινό φαινόμενο μεταξύ των μονοσυτταρικών οργανισμών, όπου τα γονίδια μπορούν να μεταφερθούν μεταξύ των απομακρυσμένων ειδών. Αυτό μπορεί να οδηγήσει στην απόκτηση νέων χαρακτηριστικών και γενετικής ποικιλομορφίας, περιπλέκοντας περαιτέρω τον ορισμό των ειδών που βασίζονται στην διασταύρωση.
Ταχεία εξέλιξη:Οι μονοκύτταροι οργανισμοί συχνά έχουν χρόνους μικρής παραγωγής και υψηλά ποσοστά μετάλλαξης, οδηγώντας σε ταχεία εξέλιξη. Αυτό σημαίνει ότι οι πληθυσμοί μπορούν να αποκλίνουν γρήγορα γενετικά, καθιστώντας τη διασταύρωση μεταξύ των μακρινών σχετικών ατόμων λιγότερο πιθανό με την πάροδο του χρόνου.
Επιπλέον, η έννοια των ειδών είναι ένα ανθρώπινο κατασκεύασμα που χρησιμοποιείται για την κατηγοριοποίηση και την κατανόηση της ποικιλομορφίας της ζωής. Ενώ η διασταύρωση είναι ένα χρήσιμο κριτήριο για τον ορισμό των ειδών σε πολλές περιπτώσεις, η εφαρμογή του σε μονοκύτταρους οργανισμούς μπορεί να είναι προβληματική λόγω των μοναδικών χαρακτηριστικών και των αναπαραγωγικών στρατηγικών τους. Αντ 'αυτού, οι ερευνητές συχνά βασίζονται σε ένα συνδυασμό γενετικών, φαινοτυπικών και οικολογικών δεδομένων για να οριοθετήσουν τα όρια των ειδών μεταξύ των μονοσυτταρικών οργανισμών.