Το χρώμα των ματιών των γατών δεν καθορίζεται άμεσα από το χρώμα του παλτό τους. Το πράσινο χρώμα των ματιών που συνδέεται συνήθως με πορτοκαλί γάτες (τζίντζερ) οφείλεται σε μια γενετική μετάλλαξη που ονομάζεται "γονίδιο χαλκού". Αυτό το γονίδιο οδηγεί σε αυξημένη παραγωγή μελανίνης στην ίριδα του ματιού, η οποία έχει ως αποτέλεσμα μια πράσινη ή πρασινωπή χροιά. Ωστόσο, είναι απαραίτητο να σημειωθεί ότι δεν έχουν όλες οι πορτοκαλί γάτες πράσινα μάτια. Κάποιοι μπορεί να έχουν μπλε, φουντουκιά ή ακόμα και κίτρινα μάτια.
Από την άλλη πλευρά, πολλά άλλα χρώματα παλτών σε γάτες, όπως μαύρο, καφέ ή λευκό, μπορούν επίσης να συνδυαστούν με πράσινα μάτια, ανάλογα με τη γενετική της γάτας και τη συνολική χρωματισμό των ματιών. Έτσι, ενώ τα πράσινα μάτια εμφανίζονται συχνά σε πορτοκαλί γάτες, δεν συνδέονται αποκλειστικά με αυτό το χρώμα του παλτό.